(Покемон Фильм: Мьюту наносит ответный удар) Команда ученых попыталась создать самого сильного Покемона за всю историю существования человечества, и им это удалось. Клон, сделанный из ДНК Покемона Мью – Мьюту был в ярости, когда узнал, что был создан только ради борьбы. В гневе, он уничтожил базу ученых и создал базу посреди океана, куда пригласил сильнейших тренеров со всего мира, чтобы те сразились против его новоиспеченных супер клонов Покемонов. Когда Эш Кетчум и его команда попадают на остров, истинные намерения Мьюту раскрываются. Тренеры и оригинальные Покемоны обьединяюся, чтобы остановить опасного и сильнейшего Покемона Мьюту. Битва против клонов Покемонов начинается!